Začal v polovině osmdesátých let jako scenárista a redaktor časopisu Amazing Heroes, jeho talentu si ovšem záhy povšimlo nakladatelství DC Comics a zaměstnalo jej jako redaktora. Roku 1992 mu Brian Augustyn svěřil komiks The Flash, jenž úspěšně vycházel dalších osm let. Záhy přišla i zakázka od druhého komiksového gigantu, společnosti Marvel Comics – po Marku Gruenwaldovi převzal Waid úlohu scenáristy komiksu Captain America a brzy se dočkal slušného kritického i čtenářského ohlasu. Vyvrcholením Waidovy dosavadní kariéry je komiks Království tvé (Kingdom come) z roku 1996, jeho pokračování jménem The Kingdom už takový úspěch bohužel nezaznamenalo. Od roku 2002 psal příběhy Fantastic Four, v prosinci 2004 se pak vrátil k psaní série Legion of Super-Heroes